Makbuz defterleri, Meclis-i Meşâyih tarafından teslim alınan evrakın kaydedilip imzalandığı defterlerdir. “Meclis-i Meşâyihin Makbuz Defteridir” anteti altında “Sıra numarası, Evrak numarası, Cins-i evrak, Melfûfât, Mahall-i vürudu, Ahzı, Tarih-i takdim, Mülahazat” başlıkları yer almaktadır ve Meclis-i Meşâyihe gelen evrakın teslim alındığına dair Meclis görevlilerinin imzaları bulunmaktadır.

Mukarrerat Zabıt defterleri, Meclis-i Meşâyih reis ve azalarının toplantı sırasında söylediği bazı önemli sözleri ve alınan kararları ihtiva etmektedir. Mukarrerat Zabıt defterlerinde “Bâb-ı Fetvâ Meclis-i Meşâyih mukarreratına mahsus zabıt defteridir” anteti bulunmaktadır ve altında “Tarih, Heyetin mevcudu, Reis ve aza isimleri”nden oluşan matbu çizelge ve Meclisin aldığı kararlar ile heyetin imzaları yer almaktadır.